تمت تهيئة هذا المتحف، في بداية القرن الماضي، بالطابق السفلي لبناية لاهوتية كاثوليكية محاذية لكاتيدرائية القديس لويس المشيدة في أواخر القرن التاسع عشر في موقع أكروبول قرطاج. و يحتوي هذا المتحف على أهم مجموعة من لقى موقع قرطاج تمتد على العهود الفينيقية- البونية و فترة أفريكا الرومانية و الفترة العربية الإسلامية.

أدخل على المتحف منذ عقدين ترميم و إصلاح لتحسين عرض المجموعات التي ما فتئت تنمو و لإطلاع الزائرين على تقنيات إبراز اللقى و حفظها و ترميمها. و تدخل إعادة هيكلته في إطار تهيئة المنتزه الأثري بقرطاج ليصبح منشأة من أعظم المنشآت المتحفية في شمال إفريقيا.